238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0405 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 749 aa  1502    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  68.05 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  41.65 
 
 		 1035 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  59.31 
 
 		 378 aa  280  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  57.5 
 
 		 828 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  43.81 
 
 		 919 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  55.85 
 
 		 522 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  52 
 
 		 576 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  47.18 
 
 		 581 aa  250  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  51.28 
 
 		 1234 aa  247  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.41 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  47.44 
 
 		 735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.89 
 
 		 461 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  40.33 
 
 		 954 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  44.36 
 
 		 329 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  35.71 
 
 		 697 aa  165  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  36.84 
 
 		 698 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.32 
 
 		 1931 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.17 
 
 		 838 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  40.47 
 
 		 875 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.56 
 
 		 366 aa  144  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  37.05 
 
 		 353 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  37.68 
 
 		 930 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.3 
 
 		 1262 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  48.95 
 
 		 870 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 		 777 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  47.8 
 
 		 1799 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.25 
 
 		 1356 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  48.61 
 
 		 819 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  47.47 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  47.13 
 
 		 823 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 		 719 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.26 
 
 		 810 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 840 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 		 1732 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  71.23 
 
 		 930 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  31.54 
 
 		 620 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  69.44 
 
 		 676 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  67.12 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  50.86 
 
 		 958 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.37 
 
 		 2554 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.06 
 
 		 3295 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  41.88 
 
 		 966 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  36.92 
 
 		 1056 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  72.86 
 
 		 848 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.95 
 
 		 786 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  33.77 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  33.47 
 
 		 374 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  72.86 
 
 		 787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  66.67 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  68.57 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.43 
 
 		 668 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  47.93 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  32.86 
 
 		 401 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  45.27 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.6 
 
 		 1387 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  53.47 
 
 		 403 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  56.52 
 
 		 361 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  53.41 
 
 		 831 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  56.52 
 
 		 390 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  48.72 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  32.41 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  38.82 
 
 		 801 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.5 
 
 		 595 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  60 
 
 		 869 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  64.29 
 
 		 294 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 358 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  64.29 
 
 		 298 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  32.3 
 
 		 311 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  36.05 
 
 		 255 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  31.84 
 
 		 681 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  64.71 
 
 		 110 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  49.47 
 
 		 389 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.96 
 
 		 368 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  39.87 
 
 		 391 aa  100  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.11 
 
 		 343 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  33.02 
 
 		 261 aa  97.8  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  60.27 
 
 		 709 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  55.71 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  48.91 
 
 		 522 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  39.86 
 
 		 630 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.99 
 
 		 933 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.57 
 
 		 547 aa  94.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.5 
 
 		 1338 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 526 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  41.35 
 
 		 433 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  38.71 
 
 		 918 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 1321 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 		 241 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  48.48 
 
 		 479 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.28 
 
 		 373 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.67 
 
 		 735 aa  87.4  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.65 
 
 		 1295 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  28.46 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.4 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  34.46 
 
 		 1004 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.76 
 
 		 1132 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  39.55 
 
 		 855 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.54 
 
 		 982 aa  82  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>