More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2093 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  70.28 
 
 		 669 aa  1003    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  100 
 
 		 673 aa  1380    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  32.52 
 
 		 691 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.11 
 
 		 685 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 722 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 680 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 671 aa  250  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.76 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 695 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 666 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 670 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 641 aa  150  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 687 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 724 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.28 
 
 		 822 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 712 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 795 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 777 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 693 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 690 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 684 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 761 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 732 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 784 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 690 aa  128  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 733 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 786 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  23.74 
 
 		 751 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 774 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 746 aa  124  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 767 aa  122  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 728 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 710 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 792 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 804 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 725 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 773 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 758 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 751 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 758 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 697 aa  115  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.05 
 
 		 755 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 692 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 752 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 734 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 764 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 738 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 702 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 747 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 735 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 713 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 743 aa  107  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 755 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 729 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 741 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 710 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 794 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 759 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 731 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 758 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 790 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 700 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 790 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 715 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 761 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 737 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 759 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 749 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 695 aa  99.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 730 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  21.62 
 
 		 729 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 736 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 694 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 711 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>