More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1884 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 562 aa  1149    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  37.92 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  36.1 
 
 		 570 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  36.77 
 
 		 571 aa  294  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 567 aa  289  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  33.92 
 
 		 545 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  34.93 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  35.08 
 
 		 579 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  35.16 
 
 		 568 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  36.74 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  36.04 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.12 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 528 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.93 
 
 		 509 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 876 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  29.59 
 
 		 582 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.73 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  32.06 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 923 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  29.61 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  34.22 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  31.66 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  29.62 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  29.62 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.33 
 
 		 533 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  25.29 
 
 		 539 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.1 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  37.75 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.07 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 		 538 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.94 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.16 
 
 		 547 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.46 
 
 		 573 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.13 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.54 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.71 
 
 		 578 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.42 
 
 		 578 aa  90.1  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.22 
 
 		 550 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 572 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.36 
 
 		 547 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.51 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.58 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  26.07 
 
 		 539 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  36.88 
 
 		 563 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 		 548 aa  87.8  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  36.88 
 
 		 563 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.34 
 
 		 528 aa  87.8  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  36.88 
 
 		 563 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  22 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.17 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.92 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.38 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.21 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.46 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.47 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.93 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  29.66 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  53.85 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.74 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.97 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.27 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.48 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.58 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  22.65 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  58.33 
 
 		 894 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.63 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  28.38 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.46 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  30.5 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.69 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.14 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.44 
 
 		 547 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.48 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.99 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  24.27 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.32 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.88 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.78 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.84 
 
 		 559 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.58 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.44 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>