296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4367 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  100 
 
 		 554 aa  1154    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  33.8 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  32.57 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  33.57 
 
 		 579 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  33.63 
 
 		 568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  33.22 
 
 		 579 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  31.69 
 
 		 567 aa  249  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  32.43 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 		 547 aa  246  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 		 876 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  31.81 
 
 		 546 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  29.78 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.11 
 
 		 530 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  29.9 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.68 
 
 		 554 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  26.77 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  28.45 
 
 		 509 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 534 aa  171  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 923 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  32.93 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  31.56 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  31.37 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  31.52 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  31.1 
 
 		 488 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.98 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.67 
 
 		 536 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.53 
 
 		 539 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.76 
 
 		 539 aa  103  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.3 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.57 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 		 539 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.8 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.8 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.8 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  23.13 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  22.37 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.46 
 
 		 544 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  24.52 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  23.48 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  24.76 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  24.76 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  24.76 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  24.76 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  24.76 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.76 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.76 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.03 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.79 
 
 		 524 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 		 545 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  23.9 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  22.63 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.14 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.37 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  24.68 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 752 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.8 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.9 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.98 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  22.42 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.67 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  33.11 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  33.11 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  33.11 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.98 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  37.76 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.58 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.43 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.65 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.33 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.12 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.12 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  32.19 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.58 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.66 
 
 		 578 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.56 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  27.9 
 
 		 528 aa  72  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.19 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  25.08 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 662 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.44 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>