240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3857 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  70.56 
 
 		 581 aa  854    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  100 
 
 		 579 aa  1196    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  94.3 
 
 		 579 aa  1142    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  54.77 
 
 		 567 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  37.23 
 
 		 545 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  39.05 
 
 		 547 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  36.73 
 
 		 546 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  33.57 
 
 		 554 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  32.1 
 
 		 530 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.82 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.55 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 923 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  48.51 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  31.97 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  32.63 
 
 		 581 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  30.1 
 
 		 488 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.22 
 
 		 554 aa  216  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.98 
 
 		 571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  30.52 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  30.71 
 
 		 488 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  31.93 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.11 
 
 		 509 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  30.13 
 
 		 488 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  29.65 
 
 		 570 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 534 aa  180  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  28.57 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  28.35 
 
 		 562 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.99 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 535 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.28 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.85 
 
 		 533 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.75 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.34 
 
 		 551 aa  118  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  23.45 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.82 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.62 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.9 
 
 		 518 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.39 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.39 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.39 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  24.16 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.43 
 
 		 539 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  26.09 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  26.09 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  26.09 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  26.09 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 538 aa  100  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  26.09 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.09 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.09 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.4 
 
 		 545 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.82 
 
 		 539 aa  97.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.78 
 
 		 550 aa  97.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.15 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  24.73 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 489 aa  94  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.27 
 
 		 553 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.85 
 
 		 581 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 539 aa  93.6  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 539 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  23.26 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.74 
 
 		 662 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.85 
 
 		 556 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 		 565 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  22.74 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  22.53 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.32 
 
 		 547 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 		 526 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.21 
 
 		 552 aa  87.8  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.34 
 
 		 522 aa  87.4  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 494 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.26 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.63 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  24.92 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.39 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.48 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  24.3 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  35.21 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  36.05 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  36.05 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  36.05 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.81 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  27.44 
 
 		 612 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.86 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.24 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>