More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3577 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
506 aa  1038    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  49.59 
 
 
521 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.49 
 
 
534 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.49 
 
 
534 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.49 
 
 
534 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  49.41 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.99 
 
 
512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  48.2 
 
 
528 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.36 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.47 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.98 
 
 
501 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  46.14 
 
 
506 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.25 
 
 
524 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.28 
 
 
518 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.94 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.35 
 
 
547 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.07 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.51 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  47.85 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  44.61 
 
 
494 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.39 
 
 
524 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.5 
 
 
506 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.8 
 
 
526 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  35.47 
 
 
522 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  36.65 
 
 
502 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 
511 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.17 
 
 
504 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.39 
 
 
545 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 
563 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.83 
 
 
561 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.47 
 
 
550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.34 
 
 
572 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 
539 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.33 
 
 
553 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
539 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
539 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
539 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.96 
 
 
544 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.11 
 
 
532 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.48 
 
 
531 aa  150  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 
540 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.27 
 
 
533 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  28.7 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 
539 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 
539 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.87 
 
 
515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.52 
 
 
545 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.36 
 
 
539 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  25.8 
 
 
561 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 
572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  26.84 
 
 
549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  27.02 
 
 
537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 
539 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.53 
 
 
549 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 
538 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  27.02 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  26.5 
 
 
551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.02 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.02 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  27.02 
 
 
537 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  27.02 
 
 
537 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  27.02 
 
 
537 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  27.02 
 
 
537 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 
582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.5 
 
 
566 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
533 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  29.69 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.46 
 
 
559 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.1 
 
 
528 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.96 
 
 
563 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.82 
 
 
565 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 
579 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.93 
 
 
581 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
533 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.29 
 
 
698 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.36 
 
 
552 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.04 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
578 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  28.85 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.78 
 
 
533 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 
561 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.78 
 
 
533 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.09 
 
 
558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.18 
 
 
534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.76 
 
 
522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.78 
 
 
572 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
522 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 
573 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.55 
 
 
566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.54 
 
 
579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 
565 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
527 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>