More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4435 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
524 aa  1092    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  55.16 
 
 
528 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  53.33 
 
 
534 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.23 
 
 
516 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.59 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.56 
 
 
524 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.41 
 
 
547 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.2 
 
 
506 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.36 
 
 
526 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  44.74 
 
 
521 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.73 
 
 
534 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  46.21 
 
 
502 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.58 
 
 
534 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.58 
 
 
534 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 
510 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.55 
 
 
518 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.27 
 
 
506 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.02 
 
 
534 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  38.67 
 
 
522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  40.38 
 
 
502 aa  356  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.64 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.69 
 
 
512 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  36.9 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.78 
 
 
501 aa  336  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.85 
 
 
494 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  36.31 
 
 
494 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
489 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.67 
 
 
511 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.32 
 
 
561 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 
563 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.1 
 
 
504 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.59 
 
 
572 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.36 
 
 
531 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.28 
 
 
545 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29 
 
 
553 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 
550 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.5 
 
 
532 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.39 
 
 
533 aa  160  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  28.55 
 
 
549 aa  160  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 
553 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 
544 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 
522 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.19 
 
 
549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 
527 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 
698 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  29.66 
 
 
573 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.09 
 
 
528 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
560 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.73 
 
 
522 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.73 
 
 
522 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.6 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.36 
 
 
515 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.88 
 
 
528 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  25.36 
 
 
551 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.48 
 
 
545 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.12 
 
 
647 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.75 
 
 
528 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  30.2 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  28.86 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.75 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  30.2 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 
527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  30.56 
 
 
547 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.43 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.93 
 
 
547 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 
582 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.75 
 
 
518 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 
572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.32 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.81 
 
 
536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.67 
 
 
540 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  26.17 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.48 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.26 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.42 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.12 
 
 
550 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 
566 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 
525 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.02 
 
 
548 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 
573 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 
579 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 
562 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.04 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.04 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.04 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.18 
 
 
569 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 
523 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.92 
 
 
566 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.59 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.72 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>