More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6967 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 534 aa  1096    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  98.69 
 
 		 534 aa  1080    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  98.69 
 
 		 534 aa  1080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.31 
 
 		 534 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  47.84 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.16 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  45.81 
 
 		 534 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.71 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.72 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  45.79 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.53 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.31 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.94 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.17 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.06 
 
 		 518 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.66 
 
 		 547 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  41.5 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  40.8 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.13 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  41.88 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.05 
 
 		 524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.4 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  33.27 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  35.27 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.44 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.14 
 
 		 545 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.7 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.35 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.15 
 
 		 532 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.45 
 
 		 563 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.09 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.36 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  25.74 
 
 		 573 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.06 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.55 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.29 
 
 		 544 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  26.06 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.08 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.85 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.74 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.31 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.19 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  29.23 
 
 		 539 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.45 
 
 		 698 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  28.18 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.2 
 
 		 540 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  29.77 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.62 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.33 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  25.44 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.71 
 
 		 550 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 		 547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  29.06 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 		 545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.72 
 
 		 539 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.32 
 
 		 755 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 		 533 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.99 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.1 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  29.14 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  31 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  31 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  28.95 
 
 		 483 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.27 
 
 		 556 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.13 
 
 		 647 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  30.63 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.83 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.85 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  28.09 
 
 		 537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.09 
 
 		 573 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4670  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.2 
 
 		 478 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0703924  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.44 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.21 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.99 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  25.22 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 		 548 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.15 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 		 539 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  27.58 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.58 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.58 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  27.58 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  27.58 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>