More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1572 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.29 
 
 
524 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.57 
 
 
516 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  100 
 
 
528 aa  1100    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  56.52 
 
 
534 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.35 
 
 
524 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.82 
 
 
506 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.62 
 
 
520 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.39 
 
 
547 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 
510 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  49.9 
 
 
502 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.17 
 
 
526 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.12 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  46.5 
 
 
521 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.78 
 
 
518 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.03 
 
 
534 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.03 
 
 
534 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.8 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.74 
 
 
534 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  38.71 
 
 
522 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  40.8 
 
 
502 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.73 
 
 
501 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.5 
 
 
512 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.23 
 
 
512 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.68 
 
 
494 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  39.21 
 
 
494 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  38.54 
 
 
506 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 
489 aa  332  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.93 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.89 
 
 
561 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.92 
 
 
563 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.52 
 
 
504 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.29 
 
 
553 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.69 
 
 
572 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 
545 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.68 
 
 
549 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.77 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 
531 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.42 
 
 
522 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 
527 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 
544 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 
698 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
553 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 
572 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.63 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.27 
 
 
522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.27 
 
 
522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.1 
 
 
527 aa  147  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 
534 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
533 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.61 
 
 
528 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 
545 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 
528 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 
579 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  27.02 
 
 
523 aa  144  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.82 
 
 
550 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.21 
 
 
522 aa  143  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.68 
 
 
522 aa  143  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 
515 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  26.19 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 
581 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.75 
 
 
533 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 
523 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  25.68 
 
 
561 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.53 
 
 
528 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.47 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 
578 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 
570 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.2 
 
 
579 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.73 
 
 
526 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.39 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  29.01 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.55 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.36 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 
548 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.24 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.85 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  25.18 
 
 
551 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 
548 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.57 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.91 
 
 
563 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
567 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 
539 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.08 
 
 
563 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.77 
 
 
565 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 
573 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25 
 
 
558 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 
552 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.5 
 
 
565 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
584 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.96 
 
 
561 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.23 
 
 
545 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.21 
 
 
647 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>