More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1077 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
504 aa  1044    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  32.84 
 
 
534 aa  239  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.47 
 
 
520 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.45 
 
 
512 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.84 
 
 
512 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.23 
 
 
547 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.85 
 
 
511 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.68 
 
 
534 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.43 
 
 
534 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.43 
 
 
534 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.91 
 
 
518 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.1 
 
 
524 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.91 
 
 
534 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  30.98 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  31.02 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  31 
 
 
528 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.9 
 
 
526 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.96 
 
 
516 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  31.57 
 
 
502 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
510 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  32 
 
 
494 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 
532 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 
506 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.52 
 
 
501 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.08 
 
 
561 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.79 
 
 
494 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 
563 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
524 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.36 
 
 
550 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
489 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.78 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.16 
 
 
573 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
572 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.88 
 
 
549 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  26.67 
 
 
522 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 
553 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.75 
 
 
534 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.63 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
533 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 
522 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.75 
 
 
544 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 
698 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.14 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.36 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.66 
 
 
522 aa  133  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.27 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  24.48 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.72 
 
 
528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 
523 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.84 
 
 
528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 
533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.56 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.56 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  25.37 
 
 
528 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  25.57 
 
 
573 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.54 
 
 
526 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  25.57 
 
 
573 aa  123  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.63 
 
 
522 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.12 
 
 
522 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.64 
 
 
538 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.72 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.06 
 
 
647 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
531 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.61 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  27.09 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.52 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.56 
 
 
570 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 
540 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.39 
 
 
566 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.9 
 
 
515 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
553 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.42 
 
 
545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.47 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.85 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.18 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.66 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.17 
 
 
539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.17 
 
 
539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.17 
 
 
539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 
547 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.22 
 
 
567 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.47 
 
 
525 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 
534 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.04 
 
 
558 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.9 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 
522 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  27.79 
 
 
483 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  27.79 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.13 
 
 
594 aa  110  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 
570 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.31 
 
 
549 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  25.13 
 
 
551 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 
579 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.76 
 
 
755 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.52 
 
 
572 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.6 
 
 
570 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>