More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3142 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  70.42 
 
 
516 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
524 aa  1096    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  59.29 
 
 
528 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.79 
 
 
506 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.56 
 
 
524 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  48.95 
 
 
534 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.35 
 
 
520 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  44.23 
 
 
522 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.97 
 
 
547 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  43.27 
 
 
502 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.31 
 
 
518 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.97 
 
 
526 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 
510 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  43.75 
 
 
502 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.66 
 
 
534 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.45 
 
 
534 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.49 
 
 
534 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.49 
 
 
534 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.47 
 
 
506 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  40.8 
 
 
521 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.51 
 
 
501 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.73 
 
 
512 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.78 
 
 
512 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  39.35 
 
 
506 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.39 
 
 
494 aa  329  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  37.55 
 
 
494 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 
489 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.18 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.78 
 
 
572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.38 
 
 
504 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 
532 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.76 
 
 
545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
550 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.79 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.02 
 
 
573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.97 
 
 
544 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.72 
 
 
522 aa  144  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.64 
 
 
527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.14 
 
 
549 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27 
 
 
545 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.32 
 
 
528 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.07 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.59 
 
 
522 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.67 
 
 
549 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.13 
 
 
540 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.01 
 
 
522 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 
527 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.94 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.55 
 
 
539 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  25.28 
 
 
523 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.94 
 
 
561 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.35 
 
 
515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.93 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  25.45 
 
 
551 aa  126  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.88 
 
 
522 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.88 
 
 
522 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
522 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 
534 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 
539 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 
539 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 
539 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.36 
 
 
526 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 
572 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.35 
 
 
528 aa  123  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.94 
 
 
526 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.72 
 
 
698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.47 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
523 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 
570 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
556 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  26.58 
 
 
563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  26.94 
 
 
563 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.44 
 
 
548 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  26.94 
 
 
563 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  25.7 
 
 
522 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 
563 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.78 
 
 
570 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  27.06 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.74 
 
 
755 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  24.64 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.44 
 
 
533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  25.72 
 
 
647 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 
566 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
533 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.46 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.92 
 
 
573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  23.96 
 
 
558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.95 
 
 
534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.31 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.39 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 
547 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.31 
 
 
547 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>