More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1062 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.92 
 
 
520 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
526 aa  1083    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  68.69 
 
 
547 aa  724    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  51.82 
 
 
534 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  47.17 
 
 
528 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.15 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.95 
 
 
524 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.34 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.97 
 
 
524 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.34 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.34 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  42.21 
 
 
521 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 
534 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.21 
 
 
506 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.42 
 
 
534 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  45.54 
 
 
502 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  45.54 
 
 
510 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.32 
 
 
506 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.9 
 
 
501 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  40.61 
 
 
506 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.42 
 
 
512 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.66 
 
 
512 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.44 
 
 
494 aa  327  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  40.64 
 
 
494 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 
489 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  34.28 
 
 
522 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  34.72 
 
 
502 aa  280  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.72 
 
 
511 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.57 
 
 
504 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 
563 aa  183  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 
561 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 
545 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 
572 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.3 
 
 
532 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 
531 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.03 
 
 
550 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.74 
 
 
544 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.35 
 
 
558 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.52 
 
 
539 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  27.04 
 
 
551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  29.89 
 
 
547 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.69 
 
 
572 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.57 
 
 
539 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
545 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.3 
 
 
556 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.89 
 
 
563 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.04 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.5 
 
 
540 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.01 
 
 
556 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.86 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.86 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.19 
 
 
527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.32 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 
539 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 
539 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 
539 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 
538 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.72 
 
 
549 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 
570 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.78 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.1 
 
 
528 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 
552 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.93 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.14 
 
 
547 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.93 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.93 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  24.96 
 
 
561 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.43 
 
 
573 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 
550 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26 
 
 
563 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.02 
 
 
548 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.71 
 
 
539 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 
534 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.85 
 
 
522 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  26.01 
 
 
551 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.01 
 
 
570 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.74 
 
 
566 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 
573 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.39 
 
 
582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.15 
 
 
573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  29 
 
 
549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  24.59 
 
 
537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.01 
 
 
522 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.01 
 
 
522 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
698 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  27.29 
 
 
647 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 
527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.38 
 
 
548 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 
553 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.95 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  24.95 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.95 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.9 
 
 
539 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  24.77 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>