268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12251 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  55.54 
 
 
547 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07591  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  63.82 
 
 
549 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  55.54 
 
 
547 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  100 
 
 
551 aa  1137    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  60 
 
 
551 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.02 
 
 
546 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  51.93 
 
 
546 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  51.01 
 
 
546 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  60.15 
 
 
547 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07041  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  51.38 
 
 
546 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6353  putative oxidoreductase protein  32.2 
 
 
550 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.48 
 
 
563 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.59 
 
 
572 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.99 
 
 
573 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
566 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  30.56 
 
 
558 aa  236  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  29.79 
 
 
565 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 
570 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.89 
 
 
567 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 
561 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.5 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  29.6 
 
 
574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 
562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
566 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  29.24 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.77 
 
 
560 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.55 
 
 
570 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 
563 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  28.91 
 
 
570 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 
565 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 
561 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.47 
 
 
570 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  29.19 
 
 
573 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.86 
 
 
582 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
574 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.78 
 
 
579 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
579 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 
578 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 
573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.01 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.6 
 
 
579 aa  174  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.32 
 
 
569 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 
570 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.74 
 
 
578 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.24 
 
 
581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 
584 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.69 
 
 
548 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.71 
 
 
527 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.12 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 
556 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
534 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.92 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.14 
 
 
527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.92 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 
522 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 
536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.74 
 
 
540 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.65 
 
 
522 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.22 
 
 
528 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.95 
 
 
553 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.08 
 
 
539 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 
539 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 
539 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 
539 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  25.09 
 
 
547 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 
526 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.43 
 
 
528 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  24.6 
 
 
539 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.17 
 
 
549 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 
526 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  25.62 
 
 
523 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.8 
 
 
531 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 
556 aa  103  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.72 
 
 
550 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.06 
 
 
548 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.57 
 
 
526 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.57 
 
 
556 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
573 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 
573 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 
539 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.59 
 
 
545 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 
548 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25.41 
 
 
563 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.54 
 
 
547 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  25.41 
 
 
563 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  25.21 
 
 
563 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.78 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 
539 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.47 
 
 
526 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.57 
 
 
538 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  23.75 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 
539 aa  97.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 
547 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  24.04 
 
 
502 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.51 
 
 
553 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.18 
 
 
506 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>