More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12661 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  59.92 
 
 
502 aa  649    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1076    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.48 
 
 
506 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.41 
 
 
516 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.23 
 
 
524 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  38.71 
 
 
528 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  37.74 
 
 
534 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.67 
 
 
524 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.04 
 
 
547 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.66 
 
 
512 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.95 
 
 
520 aa  286  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  34.56 
 
 
521 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.86 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 
534 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 
512 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.93 
 
 
518 aa  279  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.69 
 
 
534 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.69 
 
 
534 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.79 
 
 
534 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.26 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  32.25 
 
 
506 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  33.79 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
510 aa  267  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.22 
 
 
526 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
489 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  31.58 
 
 
494 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.16 
 
 
494 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.31 
 
 
511 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.47 
 
 
536 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 
540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 
544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.53 
 
 
573 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
538 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
550 aa  133  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.81 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 
527 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  27 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 
527 aa  127  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 
566 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.47 
 
 
563 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.58 
 
 
539 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  24.58 
 
 
537 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 
533 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.91 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.55 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  24.55 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.06 
 
 
549 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.55 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.6 
 
 
570 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.21 
 
 
539 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  24.55 
 
 
537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  24.55 
 
 
537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  24.55 
 
 
537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  24.55 
 
 
537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.77 
 
 
539 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.12 
 
 
563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.3 
 
 
561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.73 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.72 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.37 
 
 
533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 
548 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.35 
 
 
528 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.7 
 
 
532 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  24.96 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.3 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.68 
 
 
559 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.79 
 
 
582 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.91 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.46 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.6 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.46 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.44 
 
 
572 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 
523 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.9 
 
 
528 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.7 
 
 
528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  23.72 
 
 
551 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.2 
 
 
545 aa  110  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 
565 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.48 
 
 
552 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.78 
 
 
579 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.85 
 
 
581 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  25.52 
 
 
480 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
579 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.51 
 
 
561 aa  107  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.36 
 
 
522 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 
562 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  24.87 
 
 
547 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>