More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0822 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
548 aa  1127    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
559 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  27.48 
 
 
558 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 
572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 
561 aa  163  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.18 
 
 
572 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.86 
 
 
581 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.53 
 
 
560 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  25.34 
 
 
561 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 
561 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 
579 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.72 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
569 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 
566 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 
563 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
570 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.41 
 
 
567 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.33 
 
 
584 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 
582 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.02 
 
 
570 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 
579 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.53 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.47 
 
 
561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 
566 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.23 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  25.61 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  24.83 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.9 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 
565 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.2 
 
 
579 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 
573 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.24 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 
526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.85 
 
 
556 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  24.82 
 
 
565 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.81 
 
 
570 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  25.69 
 
 
551 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.41 
 
 
556 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
545 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 
570 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.21 
 
 
526 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.45 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  27.55 
 
 
547 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.62 
 
 
563 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.4 
 
 
522 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.4 
 
 
522 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.91 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.89 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.83 
 
 
538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.92 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.2 
 
 
573 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.78 
 
 
522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.95 
 
 
556 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.91 
 
 
528 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 
578 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.1 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.6 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.1 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.07 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.1 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26 
 
 
533 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  25.4 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 
547 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 
539 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 
522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 
573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
527 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.97 
 
 
527 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.95 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.16 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.19 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.8 
 
 
545 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  24.14 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.84 
 
 
573 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  26.49 
 
 
523 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 
534 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 
548 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.11 
 
 
548 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
522 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.29 
 
 
547 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.19 
 
 
534 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.19 
 
 
534 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  26.33 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  26.74 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  25.43 
 
 
551 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
539 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.78 
 
 
539 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.05 
 
 
520 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6353  putative oxidoreductase protein  28.96 
 
 
550 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>