239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2728 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  55.14 
 
 		 579 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  54.77 
 
 		 579 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  100 
 
 		 567 aa  1181    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  57.09 
 
 		 581 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  35.24 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  37.32 
 
 		 547 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 562 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  35.28 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.16 
 
 		 518 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  32.47 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 528 aa  249  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  31.69 
 
 		 554 aa  249  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.21 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.87 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.64 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 923 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  30.9 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  43.61 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  29.29 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  28.35 
 
 		 568 aa  200  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  28.79 
 
 		 488 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  28.6 
 
 		 570 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.8 
 
 		 571 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  28.23 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  36.59 
 
 		 581 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  33.86 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  33.73 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.01 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 		 538 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.01 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.8 
 
 		 550 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.85 
 
 		 544 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 518 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.6 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.83 
 
 		 528 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.93 
 
 		 531 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.78 
 
 		 539 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 556 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.68 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  22.78 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.63 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.97 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.8 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.55 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 		 547 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  25.46 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.26 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  24.2 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.72 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.02 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.02 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.31 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.6 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  30.67 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.82 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.26 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.08 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  29.45 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.62 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.08 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.63 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.83 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.39 
 
 		 545 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.29 
 
 		 515 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.92 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.75 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.75 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  22.65 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.83 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.1 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.47 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.94 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>