More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2585 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 554 aa  1116    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  44.23 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.42 
 
 		 876 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 		 923 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  33.73 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  34.82 
 
 		 546 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.73 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 		 562 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  33.04 
 
 		 579 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  33.16 
 
 		 579 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  30.74 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  33.68 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 513 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  30.68 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.47 
 
 		 571 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  31.86 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.64 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  30.11 
 
 		 524 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  31.13 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  27.61 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  26.68 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  30.09 
 
 		 568 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  26.37 
 
 		 488 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  25.84 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  26.32 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.08 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  25.13 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.46 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 		 533 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 		 533 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 		 533 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  26.78 
 
 		 480 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.56 
 
 		 534 aa  90.1  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  27.89 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.89 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  26.79 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.11 
 
 		 518 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 539 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 539 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 539 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.33 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.28 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.14 
 
 		 752 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  24.12 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  24.12 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  24.12 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  24.12 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  24.12 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  23.45 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  28.14 
 
 		 752 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.03 
 
 		 752 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.67 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  24.09 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.57 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.75 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.1 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.54 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.15 
 
 		 662 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.42 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  22.79 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.84 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 		 538 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.09 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.84 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  23.88 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.41 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.12 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.19 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.68 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.97 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.07 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  33.33 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.62 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.11 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.62 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.62 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.39 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  30.77 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>