224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2692 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  100 
 
 		 562 aa  1134    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  50.74 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  32.43 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  31.68 
 
 		 570 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.37 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  28.23 
 
 		 567 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.76 
 
 		 530 aa  173  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  30.81 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  28.67 
 
 		 545 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  28.35 
 
 		 579 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  31.32 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  28.67 
 
 		 579 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.41 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  27.81 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 876 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.92 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 923 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  26.27 
 
 		 582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.15 
 
 		 554 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.58 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  31.73 
 
 		 581 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  33.74 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  34.51 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.16 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  25.44 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.71 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  25.45 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.1 
 
 		 556 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.19 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.39 
 
 		 573 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  25.89 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  32.47 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  33.77 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  33.77 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.51 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.84 
 
 		 545 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.66 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.65 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.17 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.56 
 
 		 534 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  42.25 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.79 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.63 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.88 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.88 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.99 
 
 		 553 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.51 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.85 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.48 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.3 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.71 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.69 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.94 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.56 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  43.33 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 522 aa  57  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  31.08 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  29.58 
 
 		 522 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.99 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  29.45 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  41.54 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.09 
 
 		 545 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.29 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.41 
 
 		 526 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.35 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 662 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.29 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.72 
 
 		 662 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.31 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  31.78 
 
 		 523 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  26.21 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.56 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.17 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.08 
 
 		 518 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.17 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.85 
 
 		 579 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 		 527 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.81 
 
 		 549 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.45 
 
 		 540 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.61 
 
 		 532 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>