232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0632 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 534 aa  1077    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  36.81 
 
 		 524 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  29.69 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 579 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  27.86 
 
 		 579 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  29.17 
 
 		 567 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  30.15 
 
 		 546 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  26.99 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 876 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  27.89 
 
 		 582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  27.69 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  27.69 
 
 		 488 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  28.63 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  30.69 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.38 
 
 		 554 aa  153  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  27.77 
 
 		 568 aa  153  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.16 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  29.34 
 
 		 570 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  27.55 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 535 aa  147  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  27.55 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  27.55 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  29.77 
 
 		 581 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.03 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 923 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.95 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.44 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.85 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.42 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.51 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 518 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.38 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.13 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.69 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.45 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  21.64 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  22.13 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.61 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  21.59 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  48.44 
 
 		 894 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  30.97 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.38 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.85 
 
 		 548 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 		 561 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  26.45 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.04 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  33.57 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.03 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  30.13 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.61 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  24.81 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  31.25 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  30.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.66 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.07 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  30.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  30 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.25 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  47.54 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  33.82 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  33.82 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.29 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  43.04 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.1 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.56 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  35.11 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  50 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.17 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.54 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.61 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.39 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.48 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.64 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.28 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  42.86 
 
 		 528 aa  57  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.88 
 
 		 573 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.38 
 
 		 586 aa  57  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  20.17 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.48 
 
 		 591 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>