More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6262 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 923 aa  1900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  40.81 
 
 		 582 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 876 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.21 
 
 		 554 aa  350  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  33.62 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  33.1 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 581 aa  224  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  29.69 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  28.74 
 
 		 545 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  31.72 
 
 		 546 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 562 aa  208  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 528 aa  204  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  30.73 
 
 		 547 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.32 
 
 		 509 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  30.32 
 
 		 570 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.83 
 
 		 518 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  25.35 
 
 		 530 aa  167  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  29.08 
 
 		 568 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.65 
 
 		 571 aa  161  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  26.32 
 
 		 554 aa  161  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  27.15 
 
 		 524 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  26.57 
 
 		 488 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  24.6 
 
 		 488 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  26.29 
 
 		 581 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  24.6 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  27.46 
 
 		 562 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 534 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  24.51 
 
 		 488 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 535 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.46 
 
 		 533 aa  121  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 513 aa  107  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.88 
 
 		 556 aa  96.3  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.22 
 
 		 553 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.29 
 
 		 526 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.71 
 
 		 556 aa  92.8  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.17 
 
 		 547 aa  91.3  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  35.85 
 
 		 563 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  35.85 
 
 		 563 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  35.85 
 
 		 563 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 539 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 539 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 539 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 		 573 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.8 
 
 		 539 aa  89.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 		 662 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 		 662 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  22.11 
 
 		 551 aa  87.8  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.01 
 
 		 544 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.44 
 
 		 536 aa  87.8  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.08 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  36.18 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.67 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.14 
 
 		 539 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  23.36 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.14 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.57 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.2 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.62 
 
 		 548 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.52 
 
 		 520 aa  80.9  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.65 
 
 		 548 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 545 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  23.55 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  23.55 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  23.55 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  23.55 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  23.55 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  23.55 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  23.55 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.93 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  24.24 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.67 
 
 		 752 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  50.75 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.58 
 
 		 533 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  46.34 
 
 		 116 aa  74.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  30.85 
 
 		 752 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.09 
 
 		 548 aa  73.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.01 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.44 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.03 
 
 		 533 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.03 
 
 		 533 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.81 
 
 		 545 aa  72  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.03 
 
 		 533 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.32 
 
 		 522 aa  72  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  34.51 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  34.04 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.43 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.93 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.67 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  36.17 
 
 		 502 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.68 
 
 		 752 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>