290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3593 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1140    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  34.01 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  29.78 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  31.68 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  33.15 
 
 		 571 aa  213  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 876 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  28.6 
 
 		 567 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  29.65 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  29.7 
 
 		 579 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 923 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  29.8 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  29.25 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 554 aa  180  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  30.48 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 		 518 aa  170  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.95 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 534 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  28.15 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  25.04 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  34.48 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  33.49 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.77 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.93 
 
 		 556 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  33.2 
 
 		 581 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  26.93 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  26.93 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  36.81 
 
 		 488 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  37.96 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  26.4 
 
 		 563 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  36.11 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 662 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.06 
 
 		 662 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 573 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 572 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.06 
 
 		 662 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 563 aa  90.9  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.54 
 
 		 547 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26 
 
 		 662 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.38 
 
 		 573 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  24.05 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  34.81 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.14 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.85 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.14 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.69 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.67 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.25 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.25 
 
 		 533 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.25 
 
 		 533 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.93 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.77 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  32.93 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  23.81 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  32.41 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  24.43 
 
 		 752 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.89 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  28.4 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.12 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.47 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.43 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.34 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.43 
 
 		 752 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.48 
 
 		 573 aa  70.5  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  27.22 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.68 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.22 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.58 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.22 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.39 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.87 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.56 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  26.63 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  26.63 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.82 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.45 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  26.63 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.82 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  26.63 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.77 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.01 
 
 		 518 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>