290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4268 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 528 aa  1073    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 581 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  34.23 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  34.62 
 
 		 579 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  35.58 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 513 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  32.55 
 
 		 545 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 562 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.7 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  30.58 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  31.81 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  29.89 
 
 		 488 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.53 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  30.41 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  30.58 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 923 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  32.39 
 
 		 581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  30.76 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  32.04 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  28.47 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.39 
 
 		 571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  28.97 
 
 		 582 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  29.2 
 
 		 570 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  29.95 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 876 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  27.78 
 
 		 524 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 534 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.53 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 		 527 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.07 
 
 		 531 aa  90.9  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.22 
 
 		 538 aa  87.4  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 526 aa  87.4  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.75 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  23.25 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.17 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.17 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.17 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.54 
 
 		 578 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.81 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  22.24 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.81 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.11 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.09 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.17 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.57 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  36.11 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.52 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.85 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.59 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.29 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.53 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.17 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  32.16 
 
 		 894 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.45 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.25 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.22 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.03 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  34.04 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 527 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  34.59 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  22.52 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  33.57 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  33.33 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.89 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  35 
 
 		 563 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.52 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  35 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.09 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.09 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  35 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.8 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 		 528 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.24 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.03 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.45 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.23 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>