259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05760 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  100 
 
 
571 aa  1140    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
562 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  32.57 
 
 
554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  31.11 
 
 
545 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  33.69 
 
 
547 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  30.14 
 
 
579 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  29.98 
 
 
579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
513 aa  213  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  33.15 
 
 
570 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
581 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  30.57 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  28.8 
 
 
567 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  29.37 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.47 
 
 
554 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
876 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
923 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  26.7 
 
 
524 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
534 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  25.31 
 
 
530 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  37.5 
 
 
546 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.07 
 
 
518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  42.95 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
535 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  30.98 
 
 
582 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  29.39 
 
 
581 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  36.24 
 
 
488 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.22 
 
 
556 aa  87.8  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.9 
 
 
527 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.88 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.32 
 
 
524 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.75 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  29.17 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.99 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  35.04 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  34.75 
 
 
563 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.88 
 
 
553 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.89 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  35.46 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  35.46 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.88 
 
 
536 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.76 
 
 
662 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.32 
 
 
662 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.41 
 
 
548 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.84 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.46 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.43 
 
 
547 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  21.53 
 
 
537 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  21.53 
 
 
537 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  21.53 
 
 
537 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  21.53 
 
 
537 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.95 
 
 
662 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  31.17 
 
 
537 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.14 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.33 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  31.17 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  22 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  32.89 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.99 
 
 
528 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.71 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.77 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.14 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  31.29 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.14 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.14 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.62 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.59 
 
 
526 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.71 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.71 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  48.48 
 
 
745 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.82 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.52 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.69 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.94 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.52 
 
 
539 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  28.62 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.52 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 
556 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.97 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  29.88 
 
 
647 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.08 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.22 
 
 
539 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.88 
 
 
545 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  25.17 
 
 
506 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.73 
 
 
534 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 
545 aa  65.1  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  26.35 
 
 
565 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>