286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2167 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  100 
 
 		 545 aa  1138    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 581 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  37.23 
 
 		 579 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  38.96 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  37.3 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  35.24 
 
 		 567 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 513 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 562 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  33.52 
 
 		 546 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  33.8 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.73 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 876 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.51 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.71 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.11 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  30.56 
 
 		 582 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 923 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.7 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  28.88 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  30.39 
 
 		 581 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  28.78 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  29.25 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  28.67 
 
 		 562 aa  169  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  27.17 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  26.75 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  27.99 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  42.96 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.33 
 
 		 545 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.33 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.89 
 
 		 531 aa  97.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.34 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  23.43 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 		 538 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.13 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.11 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.11 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.11 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  26.17 
 
 		 537 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.17 
 
 		 537 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.17 
 
 		 537 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.05 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.22 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  25.55 
 
 		 537 aa  88.6  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.37 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.93 
 
 		 523 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.81 
 
 		 556 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  26.17 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  26.17 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  26.17 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  26.17 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.62 
 
 		 566 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.87 
 
 		 573 aa  87  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.47 
 
 		 527 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.29 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.5 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.5 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.2 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.83 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.83 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.36 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.05 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.45 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  24.65 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.67 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.43 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.97 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.97 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  38.57 
 
 		 563 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.97 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  38.57 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  38.57 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.72 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.69 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.86 
 
 		 544 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  25.27 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  22.45 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.57 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.06 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  34.34 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.34 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.57 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.81 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.04 
 
 		 525 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.76 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.76 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.18 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  32.14 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>