243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2465 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 581 aa  1200    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  70.61 
 
 		 579 aa  850    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  70.56 
 
 		 579 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  57.09 
 
 		 567 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  38.39 
 
 		 545 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  39.61 
 
 		 547 aa  329  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  34.62 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  34.64 
 
 		 546 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 528 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.47 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 876 aa  250  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  32.65 
 
 		 581 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  30.49 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  30.89 
 
 		 582 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 923 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.04 
 
 		 554 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  29.71 
 
 		 509 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  32.7 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  31.43 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.84 
 
 		 571 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 534 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  30.14 
 
 		 568 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.79 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  28.25 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  34.25 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  34.25 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  34.13 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.86 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.87 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  23.65 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.79 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.96 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 550 aa  107  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.89 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.13 
 
 		 531 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.72 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.72 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.03 
 
 		 533 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 		 539 aa  98.6  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  23.36 
 
 		 534 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  26.28 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.14 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  23.12 
 
 		 537 aa  95.5  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.79 
 
 		 523 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.65 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 		 614 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.48 
 
 		 528 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.56 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 662 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 539 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 539 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.95 
 
 		 522 aa  90.5  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.52 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.57 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.51 
 
 		 662 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 		 565 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.83 
 
 		 662 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 		 544 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.48 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.08 
 
 		 548 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.27 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.9 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  25.71 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25.71 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  25.71 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.59 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.8 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.08 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.34 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  32.47 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.99 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.87 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.87 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  22.26 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.15 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.22 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>