285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_07141 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  79.63 
 
 
546 aa  915    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  80.04 
 
 
546 aa  926    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07041  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  80.04 
 
 
546 aa  905    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  100 
 
 
546 aa  1128    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.02 
 
 
551 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07591  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  54.14 
 
 
549 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.42 
 
 
547 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.23 
 
 
547 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  49.91 
 
 
551 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  50.19 
 
 
547 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.66 
 
 
563 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.66 
 
 
573 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6353  putative oxidoreductase protein  30.54 
 
 
550 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.94 
 
 
572 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  31.14 
 
 
561 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  31.18 
 
 
565 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.34 
 
 
561 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  31.13 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.6 
 
 
562 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 
561 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 
566 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.55 
 
 
566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.31 
 
 
570 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.8 
 
 
560 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.53 
 
 
567 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  30.12 
 
 
574 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 
559 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.32 
 
 
563 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.95 
 
 
569 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.35 
 
 
582 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.74 
 
 
570 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 
579 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.04 
 
 
565 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.62 
 
 
570 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  29.49 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.22 
 
 
572 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.72 
 
 
570 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  28.91 
 
 
573 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.6 
 
 
574 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.01 
 
 
579 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.47 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 
570 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.28 
 
 
573 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 
569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 
578 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.9 
 
 
578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.57 
 
 
584 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 
527 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.16 
 
 
531 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
528 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 
528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.4 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.39 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.39 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.04 
 
 
515 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.69 
 
 
526 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 
548 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 
534 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.14 
 
 
548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.32 
 
 
553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.39 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.05 
 
 
533 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.15 
 
 
533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  23.13 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.74 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 
533 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 
533 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.16 
 
 
551 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  22.9 
 
 
547 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.02 
 
 
518 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.46 
 
 
556 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 
553 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  25.4 
 
 
573 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.97 
 
 
556 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.13 
 
 
526 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.82 
 
 
556 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.47 
 
 
545 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.5 
 
 
573 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.11 
 
 
614 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.46 
 
 
522 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  24.13 
 
 
522 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.56 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.36 
 
 
534 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.54 
 
 
547 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.93 
 
 
526 aa  96.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.93 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.55 
 
 
573 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.51 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.66 
 
 
538 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.42 
 
 
589 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.88 
 
 
752 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 
550 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  24.03 
 
 
752 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.76 
 
 
752 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  22.84 
 
 
506 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>