287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_07041 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  93.58 
 
 
546 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  93.59 
 
 
546 aa  1060    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07041  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  100 
 
 
546 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  80.04 
 
 
546 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07591  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  54.53 
 
 
549 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12251  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  51.38 
 
 
551 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.89 
 
 
547 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  53.89 
 
 
547 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  50.09 
 
 
547 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  48.79 
 
 
551 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.41 
 
 
563 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6353  putative oxidoreductase protein  29.98 
 
 
550 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.9 
 
 
562 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.96 
 
 
573 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.99 
 
 
572 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  31.24 
 
 
565 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  30.55 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.47 
 
 
559 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 
560 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  29.65 
 
 
558 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.36 
 
 
570 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.37 
 
 
566 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.64 
 
 
569 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.36 
 
 
561 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.95 
 
 
561 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 
563 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.95 
 
 
567 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.38 
 
 
570 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 
582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.05 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  29.65 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.27 
 
 
565 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 
572 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.97 
 
 
579 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  29.49 
 
 
570 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.14 
 
 
570 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  28.15 
 
 
573 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.82 
 
 
570 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
570 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 
579 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.92 
 
 
565 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 
573 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.23 
 
 
581 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.12 
 
 
579 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 
569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.64 
 
 
578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.26 
 
 
584 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.24 
 
 
518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.11 
 
 
528 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 
522 aa  120  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  23.8 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.92 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.34 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.71 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.15 
 
 
522 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.2 
 
 
528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.48 
 
 
522 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.48 
 
 
522 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.67 
 
 
528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.08 
 
 
534 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 
548 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
553 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.6 
 
 
527 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.2 
 
 
531 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.74 
 
 
551 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.08 
 
 
548 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.15 
 
 
533 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
523 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.83 
 
 
550 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.61 
 
 
545 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  22.3 
 
 
506 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.95 
 
 
556 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.98 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.98 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.8 
 
 
526 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  23 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 
533 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.11 
 
 
548 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.04 
 
 
522 aa  94  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  22.12 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  24.31 
 
 
573 aa  91.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.47 
 
 
522 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  22.92 
 
 
523 aa  91.3  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 
556 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.39 
 
 
512 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.44 
 
 
573 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.61 
 
 
545 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.7 
 
 
511 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.17 
 
 
526 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.51 
 
 
521 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.93 
 
 
539 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.22 
 
 
573 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.43 
 
 
536 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.38 
 
 
522 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  23.14 
 
 
539 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.16 
 
 
534 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>