More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2058 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 630 aa  1234    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  78.79 
 
 		 630 aa  920    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 952 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 969 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.01 
 
 		 1087 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 1043 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.06 
 
 		 1017 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  34.36 
 
 		 1110 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 1066 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.28 
 
 		 957 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.6 
 
 		 1125 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.34 
 
 		 1049 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.67 
 
 		 1100 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  33.88 
 
 		 960 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.66 
 
 		 943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 1093 aa  193  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.99 
 
 		 1058 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.86 
 
 		 1092 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32.95 
 
 		 1055 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.56 
 
 		 1072 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.26 
 
 		 1056 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.75 
 
 		 1102 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.47 
 
 		 1018 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.84 
 
 		 1103 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.94 
 
 		 1050 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 1042 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  32.71 
 
 		 1158 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.14 
 
 		 1036 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30.79 
 
 		 1058 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.36 
 
 		 999 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 1005 aa  170  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 1082 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 963 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  30.79 
 
 		 943 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 1186 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.92 
 
 		 1097 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.47 
 
 		 701 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  33.78 
 
 		 1048 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 922 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.08 
 
 		 1064 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 1049 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 941 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 755 aa  150  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 1054 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 1027 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 1100 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.61 
 
 		 1085 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  29.69 
 
 		 1131 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 980 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1094 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 981 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 910 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 621 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.06 
 
 		 921 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 882 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 775 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  31.69 
 
 		 996 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 990 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 887 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 961 aa  137  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 965 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1003 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 950 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 972 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  31.99 
 
 		 1028 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  35.37 
 
 		 760 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 1017 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.87 
 
 		 840 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 919 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 886 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.37 
 
 		 827 aa  133  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.71 
 
 		 930 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  28.89 
 
 		 964 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 1076 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  30.87 
 
 		 1060 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.82 
 
 		 496 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 1088 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 779 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 1137 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 768 aa  130  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 1064 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.31 
 
 		 916 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.73 
 
 		 824 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 1001 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  29.25 
 
 		 995 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  33.43 
 
 		 792 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.25 
 
 		 1339 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 878 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 922 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 1227 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 831 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 989 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  33.44 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.09 
 
 		 921 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30.14 
 
 		 1145 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 490 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 1071 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 393 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 906 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>