More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2064 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 697 aa  1443    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  41.34 
 
 		 712 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  41.38 
 
 		 732 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  41.27 
 
 		 743 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  39.65 
 
 		 748 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  39.65 
 
 		 757 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  41.27 
 
 		 743 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  40.94 
 
 		 744 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 		 729 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  39.61 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 		 744 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 736 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  42.79 
 
 		 733 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  42.18 
 
 		 729 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 730 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 744 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 726 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 687 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  31.18 
 
 		 714 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 696 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 853 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 851 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 695 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 687 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 704 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.76 
 
 		 715 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 690 aa  173  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 690 aa  172  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 779 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 713 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 710 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 711 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 695 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 694 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 694 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 795 aa  157  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 694 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 719 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 702 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 713 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 774 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 726 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 730 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 764 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 732 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 737 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 747 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 712 aa  142  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 710 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 731 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 765 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 722 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.93 
 
 		 685 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 773 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 743 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 775 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 694 aa  137  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 778 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 773 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 761 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 670 aa  135  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 713 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  23.67 
 
 		 856 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 753 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.27 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 771 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 666 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 784 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 688 aa  127  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 822 aa  127  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 777 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 641 aa  127  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 669 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 		 751 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 684 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 731 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 686 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 743 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 703 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 736 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 762 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  23.26 
 
 		 694 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>