More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0062 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 436 aa  876    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  71.57 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  69.85 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  62.28 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  39.95 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  39.25 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  35.73 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  39.03 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  35.88 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  35.46 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  37.25 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  34.01 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.57 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.71 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.59 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  39.81 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.87 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  33.92 
 
 		 412 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.95 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.62 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.55 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  35.83 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 421 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.75 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.29 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.85 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 435 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 400 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  25.17 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  30.09 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.89 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.18 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.86 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>