More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3572 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
427 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  50.47 
 
 
426 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 
424 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  46.93 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
399 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  34.79 
 
 
434 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  33.76 
 
 
440 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 
446 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  32.14 
 
 
430 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
430 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 
422 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
486 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
459 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.45 
 
 
426 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
402 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
425 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 
423 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
429 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.82 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.17 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 
416 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.69 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.39 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.91 
 
 
366 aa  126  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.43 
 
 
430 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
430 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
420 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
433 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.07 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.42 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.42 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
424 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.53 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
419 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  33.53 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
413 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.88 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
407 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
410 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
435 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
423 aa  109  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
420 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
461 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
437 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
415 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
432 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
411 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
411 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
414 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.73 
 
 
421 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
439 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
419 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
420 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
444 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
420 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
419 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
436 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
414 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
436 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
504 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
460 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.42 
 
 
463 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
441 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
455 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
412 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
425 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
444 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
456 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
437 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
443 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
432 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.01 
 
 
427 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
414 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.9 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.14 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  27.91 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
445 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
419 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.71 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>