More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0348 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 419 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  45.05 
 
 		 431 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  44.69 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.27 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  43.29 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.64 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.01 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  28.16 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  32.08 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.29 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.16 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.12 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.37 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.12 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 400 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 408 aa  96.3  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.03 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.61 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.54 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.98 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.86 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  26.94 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.06 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.39 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>