More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2526 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
421 aa  865    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  45.73 
 
 
439 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  46.91 
 
 
419 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  43.66 
 
 
424 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 
423 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
421 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  41.71 
 
 
423 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
423 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  41.94 
 
 
421 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  41.65 
 
 
424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
421 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 
420 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
425 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  42.78 
 
 
430 aa  308  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  37.8 
 
 
522 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 
411 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 
411 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 
413 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
414 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
425 aa  190  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 
437 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
412 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 
446 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
436 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
440 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 
419 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  32.4 
 
 
434 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
439 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.89 
 
 
418 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  35.12 
 
 
438 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
453 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 
428 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.12 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.91 
 
 
466 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
455 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 
419 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.94 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.79 
 
 
421 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
514 aa  123  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.08 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 
412 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 
412 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
436 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
424 aa  104  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
448 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.63 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.63 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
511 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
431 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
386 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.27 
 
 
496 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
424 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
724 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.42 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.28 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.65 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  27.65 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>