231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0282 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
423 aa  861    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  46.65 
 
 
433 aa  339  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  42.3 
 
 
420 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.82 
 
 
402 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  39.75 
 
 
400 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  39.16 
 
 
416 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
465 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
465 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
465 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  34.64 
 
 
468 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  35.81 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
436 aa  246  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 
464 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  36.03 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  36.84 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  34.41 
 
 
464 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 
429 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  34.06 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.85 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.61 
 
 
434 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  34.41 
 
 
419 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.15 
 
 
418 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
428 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  32.46 
 
 
428 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  32.49 
 
 
434 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 
437 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
411 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 
436 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
439 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
414 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
411 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
420 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
426 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 
440 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
419 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
436 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.11 
 
 
421 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.57 
 
 
438 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 
430 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  26.74 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.53 
 
 
424 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  28.33 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  28.48 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
423 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
412 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 
522 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
466 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
419 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
412 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
412 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
412 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 
454 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 
415 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
724 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.96 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.26 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.35 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0477  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  33.81 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>