More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2940 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  87.41 
 
 
421 aa  744    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  76.96 
 
 
423 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
421 aa  861    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  64.32 
 
 
422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  64.44 
 
 
425 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  49.52 
 
 
423 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  47.27 
 
 
439 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  48.07 
 
 
430 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  48.76 
 
 
419 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  43.4 
 
 
424 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  44.84 
 
 
423 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  43.16 
 
 
424 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
421 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 
420 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  38.99 
 
 
522 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 
413 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
411 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
411 aa  272  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  39.6 
 
 
414 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 
428 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 
411 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
412 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 
437 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
425 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 
446 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
439 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
455 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.29 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 
419 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
453 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 
418 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
464 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  33.9 
 
 
428 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 
434 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
447 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
428 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.5 
 
 
438 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
440 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.74 
 
 
421 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
363 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
433 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.99 
 
 
433 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.55 
 
 
402 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.42 
 
 
420 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.86 
 
 
422 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 
437 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
416 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.48 
 
 
431 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
419 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
439 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
412 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
400 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
514 aa  97.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.93 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
448 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
429 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.71 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.57 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.57 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
511 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  28.05 
 
 
464 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 
724 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
465 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
465 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
465 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
513 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.07 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.22 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.64 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.22 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.02 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>