More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1626 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 418 aa  848    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  72.35 
 
 		 419 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  42 
 
 		 434 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  45.13 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  45.62 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  43.84 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  34.37 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  36.13 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  36.04 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  34.93 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  35.13 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  34.65 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 		 421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.84 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  34.22 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  31.63 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  32.19 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.61 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.51 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.1 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.24 
 
 		 402 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  32.91 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  33.62 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.09 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.9 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  28.72 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 483 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.97 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.18 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 724 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.62 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 431 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.2 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.64 
 
 		 496 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.7 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.35 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>