189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3851 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  93.12 
 
 
464 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
436 aa  883    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  44.55 
 
 
429 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.82 
 
 
434 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  43.81 
 
 
427 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  40.51 
 
 
437 aa  328  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  41.81 
 
 
447 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.14 
 
 
436 aa  292  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
433 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  33.1 
 
 
420 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
400 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  31.98 
 
 
416 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 
483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
465 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
465 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
465 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.6 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.84 
 
 
468 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
428 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
428 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.94 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
426 aa  123  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
436 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
414 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
411 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
411 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
413 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
455 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
453 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
425 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
412 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
439 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.29 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.11 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  26.76 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.51 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.58 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.39 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.4 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  20.95 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  21.31 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.19 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
724 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>