281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3934 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  890    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  60.5 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  57.75 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  56.11 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  56.47 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  47.09 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  41.97 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  32.47 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.05 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  30.88 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.03 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 425 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.61 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 436 aa  93.2  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.82 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.92 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.34 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.43 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.74 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.33 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.49 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.41 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  20.51 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.99 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  30.25 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>