More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4015 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  888    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  66.98 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  64.3 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  46.82 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  44.05 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  44.13 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  33.41 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.26 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  32.8 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.07 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  34.2 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.93 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.9 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.71 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.09 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 		 522 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 413 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.75 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.03 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.48 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.12 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.52 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.22 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 464 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.15 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  27.88 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.33 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 724 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.68 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 386 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.87 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.66 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 443 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>