More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0258 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
419 aa  866    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  61.26 
 
 
424 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  61.26 
 
 
424 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  61.11 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  53.49 
 
 
430 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 
423 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  53.4 
 
 
421 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  51.49 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  46.62 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  48.32 
 
 
421 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  49.26 
 
 
421 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  49 
 
 
423 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  49.25 
 
 
425 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  47.73 
 
 
423 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  46.21 
 
 
421 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 
413 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 
411 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 
411 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  41.4 
 
 
522 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 
411 aa  293  5e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
414 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 
428 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  37.02 
 
 
437 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 
425 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 
439 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  35.45 
 
 
428 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  35.03 
 
 
446 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 
455 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  34.75 
 
 
438 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
428 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 
436 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  35 
 
 
422 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
453 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  37.06 
 
 
433 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.15 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  35.27 
 
 
421 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 
440 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 
466 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.6 
 
 
464 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 
426 aa  166  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
434 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 
419 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  31.66 
 
 
418 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
363 aa  146  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
436 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
423 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
433 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
420 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
514 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
416 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.26 
 
 
454 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
412 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27 
 
 
402 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
412 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
464 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
419 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
412 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
419 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
416 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
408 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
511 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.75 
 
 
496 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
436 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
412 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.38 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.38 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.88 
 
 
436 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.42 
 
 
521 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 
449 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  28.06 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.19 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>