237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11260 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  74.16 
 
 
465 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  74.16 
 
 
465 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  74.16 
 
 
465 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  100 
 
 
468 aa  948    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  49.68 
 
 
483 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  48.08 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  40.63 
 
 
420 aa  329  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.82 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  36.44 
 
 
416 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 
433 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  37.79 
 
 
400 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 
423 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 
447 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 
437 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
429 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
436 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.41 
 
 
436 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.44 
 
 
434 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  31.39 
 
 
427 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
428 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.91 
 
 
418 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 
419 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 
434 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 
428 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 
436 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.75 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 
426 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.18 
 
 
421 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 
425 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
455 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 
446 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
411 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
411 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 
448 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
414 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.89 
 
 
422 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
431 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.27 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
430 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
464 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
421 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
415 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.9 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.92 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
418 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.65 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 
724 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.27 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.66 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0477  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  29.79 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.41 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.2 
 
 
426 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.96 
 
 
496 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.16 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 
410 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 
410 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
425 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
412 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
439 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
439 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>