More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0397 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
428 aa  876    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  45.37 
 
 
437 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  44.31 
 
 
425 aa  359  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  47.58 
 
 
411 aa  346  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  47.58 
 
 
411 aa  346  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  44.87 
 
 
411 aa  338  8e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 
414 aa  317  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 
413 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 
439 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  39.55 
 
 
446 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
455 aa  292  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 
436 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 
422 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  39.84 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 
440 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 
419 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  37.84 
 
 
430 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 
423 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  36.13 
 
 
434 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
428 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  38.04 
 
 
466 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 
421 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  39.02 
 
 
421 aa  259  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 
421 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 
447 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  32.03 
 
 
438 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  36.51 
 
 
439 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  36.83 
 
 
419 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  39.46 
 
 
423 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  37.93 
 
 
464 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
424 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 
425 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.79 
 
 
424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.41 
 
 
421 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
453 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
423 aa  227  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  33.01 
 
 
426 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.7 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  32.99 
 
 
418 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 
522 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.41 
 
 
418 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 
420 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  31.05 
 
 
433 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 
412 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 
412 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
423 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 
433 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 
412 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
429 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.5 
 
 
402 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
420 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
436 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
416 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 
419 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 
363 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  30.89 
 
 
468 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 
400 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
411 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.45 
 
 
431 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
464 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
435 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
483 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.5 
 
 
426 aa  150  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
444 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
424 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
427 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
415 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.85 
 
 
452 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
464 aa  136  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
420 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.18 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
437 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
412 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
432 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 
436 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.13 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.22 
 
 
521 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
473 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
433 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
724 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>