More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0669 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  887    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  71.4 
 
 		 446 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  65.78 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  62.94 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 413 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.44 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.84 
 
 		 434 aa  216  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 		 419 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 419 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.28 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  37.01 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.75 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.14 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.81 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  31.21 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  34.93 
 
 		 522 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.32 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.21 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.88 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.97 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.84 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.9 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.27 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.18 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.99 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  29.35 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.63 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.65 
 
 		 496 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.7 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 412 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>