More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0213 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
446 aa  904    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  78.55 
 
 
455 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  71.82 
 
 
439 aa  591  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  69.85 
 
 
436 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
428 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
411 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
411 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  35.75 
 
 
437 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 
413 aa  250  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 
425 aa  250  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
414 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
411 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 
421 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.94 
 
 
428 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  36.64 
 
 
439 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.98 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 
440 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  34.61 
 
 
464 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  35.8 
 
 
419 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 
428 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.44 
 
 
421 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 
422 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  38.34 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 
466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
421 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
423 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.32 
 
 
424 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.17 
 
 
418 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.68 
 
 
422 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 
447 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 
419 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
423 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
420 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.53 
 
 
421 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  35.95 
 
 
522 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.39 
 
 
426 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.38 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
430 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
421 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.15 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
433 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.87 
 
 
402 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 
418 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
412 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
420 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
412 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
412 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
412 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
448 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.17 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
424 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
419 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
423 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.13 
 
 
435 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.16 
 
 
426 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
426 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
416 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
415 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
433 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.54 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.15 
 
 
454 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
441 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.79 
 
 
521 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 
436 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
410 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.76 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
429 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
427 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
511 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  23.68 
 
 
468 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
437 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.73 
 
 
447 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
410 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>