More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0413 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  87.59 
 
 
428 aa  756    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
428 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  62.35 
 
 
434 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  46.28 
 
 
426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  44.79 
 
 
419 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  45.13 
 
 
418 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  36.53 
 
 
437 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 
425 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
453 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.41 
 
 
448 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 
436 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
414 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 
411 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 
411 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  37.04 
 
 
522 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
424 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.31 
 
 
424 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  35.63 
 
 
439 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.7 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 
420 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
419 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
430 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
420 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
447 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
411 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
423 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 
440 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
433 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.75 
 
 
438 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 
416 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
421 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
422 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 
464 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.29 
 
 
421 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
454 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
423 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
421 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
465 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
465 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
465 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.12 
 
 
422 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 
402 aa  146  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
425 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
436 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.7 
 
 
421 aa  143  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32 
 
 
521 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  28.28 
 
 
468 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
464 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
418 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.32 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
412 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
412 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 
724 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
412 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
437 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
386 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
441 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
416 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
429 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
408 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
444 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
444 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
447 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
387 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
382 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
427 aa  96.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.4 
 
 
496 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.03 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 
435 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
411 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
436 aa  93.6  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.14 
 
 
439 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>