More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5508 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 412 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  98.06 
 
 		 496 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  96.12 
 
 		 446 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  95.87 
 
 		 412 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  58.27 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  57.99 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 428 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.8 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.8 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.71 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.02 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.45 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  25.91 
 
 		 422 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  28.14 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 436 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 439 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0640  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25.45 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 436 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 447 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.06 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>