More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3146 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
439 aa  897    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  60.45 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  58.25 
 
 
423 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  52.57 
 
 
424 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  53.92 
 
 
424 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  56.58 
 
 
421 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  52.72 
 
 
423 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  52.62 
 
 
430 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  49.11 
 
 
420 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 
422 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 
423 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  47.14 
 
 
421 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  50.13 
 
 
425 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  45.1 
 
 
421 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  41.19 
 
 
522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
411 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 
413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 
428 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  36.64 
 
 
446 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  32.6 
 
 
425 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 
455 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 
419 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
439 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.93 
 
 
418 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 
428 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
436 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.71 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  33.7 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 
426 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 
419 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  35.01 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
447 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
363 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.52 
 
 
422 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.48 
 
 
421 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
440 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.22 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 
436 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
419 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 
419 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
514 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
431 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 
419 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.56 
 
 
402 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
511 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
416 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
412 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
441 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
416 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
724 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 
437 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
513 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.73 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.74 
 
 
454 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
400 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.85 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
400 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
465 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
465 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
465 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.85 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.12 
 
 
496 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 
521 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
436 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
412 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
446 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
438 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
464 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.25 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>