More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1658 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
449 aa  928    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  46.24 
 
 
449 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  40.94 
 
 
447 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  28.6 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
436 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
411 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
411 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
444 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  28.75 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
414 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.02 
 
 
422 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.02 
 
 
422 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
435 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
444 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
442 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
422 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
428 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
435 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
423 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.72 
 
 
438 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
438 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
498 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  23.29 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.67 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
445 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
421 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.35 
 
 
418 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.07 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
477 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
440 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
425 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
434 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
440 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
431 aa  84  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  22.3 
 
 
438 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.7 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.4 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  22.91 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  27.06 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.23 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  21.7 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>