More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5468 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  95.02 
 
 
442 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  70.81 
 
 
444 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
442 aa  894    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  58.62 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
397 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.95 
 
 
422 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.71 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  31.73 
 
 
435 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
495 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  27.25 
 
 
464 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4037  ABC sugar transporter, periplasmic lignad binding protein  26.09 
 
 
429 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0204263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
447 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
443 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
477 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 
435 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
439 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.74 
 
 
426 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  28.74 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.74 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.74 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.74 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.74 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.86 
 
 
399 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
433 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 
440 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.34 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
440 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.57 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.99 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.39 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 
433 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.74 
 
 
439 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
499 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
481 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
423 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.44 
 
 
421 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  29.13 
 
 
447 aa  106  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  28.3 
 
 
441 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
434 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2566  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
478 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
436 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 
437 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
441 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.25 
 
 
479 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  29.08 
 
 
441 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
470 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
421 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
421 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
421 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
436 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
437 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
452 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
439 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
450 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
436 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  28.7 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
436 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
437 aa  97.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
439 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  26.08 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
436 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
435 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2011  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
480 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>