More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2610 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
477 aa  986    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  58.49 
 
 
487 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 
449 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.04 
 
 
447 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
442 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
411 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
433 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
444 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
414 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
411 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
428 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.46 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.23 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
422 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
536 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
477 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
412 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.42 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
412 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  25.06 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.42 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.28 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.39 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 
421 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.13 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  25.51 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
458 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.29 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 
434 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.71 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  25.62 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.27 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.88 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  23.88 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.88 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.88 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.88 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.6 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  21.52 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.85 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>